卫生部２１日下午表示，两岸两会刚刚签署的《海峡两岸医药卫生合作协议》，将进一步深化两岸医药卫生合作，推动两岸关系和平发展，同时，为两岸医药卫生界搭建起更广阔的交流合作平台，为保障两岸人民的健康做出实质性的推进工作。
卫生部表示，协议签署后，两岸卫生、药监、质检、中医药等业务主管部门将通过联络人渠道建立对口联系，开展信息交换、工作会晤、技术交流等合作，同时将设立若干工作组具体落实协议内容。
