流脑发病初期有的可以出现像感冒的症状，如流鼻涕、鼻咽干燥、嗓子痛、全身不适等，应与感冒、急性扁桃体炎相区别，二者主要区别为：
1、流脑为一种传染病，有传染源与明显的流行季节，而扁桃体炎不是传染病，无传染病的特征。
2、咽部体征，流脑为轻度充血，一般无扁桃腺肿大;而扁桃体炎常为重度充血或有炎性分泌物,多伴有扁桃腺肿大。
3、流脑全身症状较重，而流感、扁桃体炎则较轻。
4、流脑有出血点，神经中枢症状如嗜睡、烦躁、昏迷较明显；扁桃体炎一般无神经症状。 5、脑膜刺激征是流脑与急性扁桃体炎的主要鉴别依据之一。
